1、有些企业瓶装水与桶装水的生产工艺是不一样的，譬如：瓶装水使用臭氧灭菌、桶装水使用过滤除菌和（或）紫外灭菌；桶装水流通快，没必要像瓶装水那样入库等臭氧分解完毕再进入流通环节。

2、桶装水的包装密封性较瓶装水差，储运过程中容易吸入空气导致微生物污染；且桶装水是没有外包装的，直接接触外界空气。储运过程产品直接受力，产品内外压差波动大，很容易短暂密封失效；保质期过长或长期贮存容易微生物超标。

3、大部分桶装水生产线（尤其是旋转灌装机），内洗机与灌装机之间的输送链很难确保无菌；而较先进的非接触式定量灌装机对于灌装空间的净化要求很高，灌装间空气洁净度须维持在万级下局部百级或整体千级。

4、桶装水的物流成本很高，通常销售半径都在城区范围内，部分覆盖郊区，很少跨地销售；且桶装水流转速度很快，通常流转不会超过一周，保质期没必要很长；且短保质期还可以避免配送商“先进先出”不完整。

5、桶装水设备与厂房投资低（先进的2000BPH全自动线含水处理也只有600万左右），行业门槛低；导致小很多作坊式小企业出现，小企业整体质量管理水平不高。

桶装水打开后的保质期

桶装水在开封后接触到细菌引起污染，这些细菌的主要来源于手、杯子、饮水机等。 如果是手触碰桶装水的封口，很容易将细菌残留在桶口上；如果是杯子不经常清洗也会使细菌残留；饮水机是很容易滋生细菌的地方，因为桶装水内的杂质、矿物质都会沉淀在饮水机的内胆里，时间一长，就会严重影响到饮用水的质量。开封了的桶装水的保质期较长只有15天，较佳饮用时间为5~7天。开封的桶装水如果放置超过半个月，虽然口感没有什么变化，但细菌已经超标。所以我们喝桶装水的时间不宜太长。如果超过了15天还没有喝完的话，剩下的水就不要再喝了，可作其它处理，不要浪费。